Mille anni fa, i quattro maghi più famosi dell’epoca, Godric Grifondoro, Tosca Tassorosso, Cosetta Corvonero e Salazar Serpeverde, decisero di fondare una scuola: costruirono il castello ben lontano dagli occhi dei babbani poiché in quegli anni maghi e streghe erano continuamente perseguitati.

Inizialmente i fondatori lavorarono in armonia, cercando giovani che possedevano doti magiche e conducendoli nel castello per educarli. Ma poi tra loro nacquero dei disaccordi: ognuno cercava tra i suoi allievi caratteristiche precise, e ciò li spinse a fondare quattro case: Grifondoro, Tassorosso, Corvonero e Serpeverde.

Salazar Serpeverde voleva selezionare con maggior severità gli studenti della scuola; era convinto infatti che il sapere magico dovesse essere custodito dalle famiglie di soli maghi, gli studenti mezzosangue (nati da babbani) erano per Serpeverde inaffidabili. Egli allora costruì nel castello la Camera dei Segreti, una stanza segreta di cui gli altri fondatori ignoravano l’esistenza. Prima di lasciare il castello, la sigillò in modo che nessuno avrebbe potuto aprirla eccetto il suo erede. Aprendo la camera si sarebbe liberato un mostro, un Basilisco, che avrebbe purificato la scuola da coloro che, almeno secondo Serpeverde, non erano degni di frequentarla.

Oltre ai dormitori degli studenti, le aule, i sotterranei, i corridoi, le sale e gli uffici dei professori, esiste nella scuola una stanza molto speciale, chiamata "La Stanza delle Necessità". Compare dopo che si passa davanti al muro per tre volte e pensando intensamente a quello che si desidera, ed entrandovi ci puoi trovare tutto quello che ti serve in quel momento. È utilizzata da Harry e i suoi compagni per le Esercitazioni Segrete, Silente dice di averla trovata una notte piena di vasi da notte quando era in cerca di un bagno e per Gazza non è altro che uno sgabuzzino dove trovare prodotti che usa per tenere pulita la scuola.